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安序源發(fā)布四代納米孔測序平臺,突破低成本長讀長。-觀速訊

2023-05-30 15:47:14        來源:   動脈網(wǎng)

2023年1月,國際頂尖期刊《Nature Methods》雜志將“Method of Year 2022(2022年年度科學方法)”授予了:長讀長測序(Long-read sequencing)。 該技術憑借在基因組、轉錄組、表觀遺傳組、同基因組學等研究中的價值與優(yōu)勢,以及在近年來的重大方法學進步和廣泛應用,獲得了2022年科學界的一致認可。


(資料圖)

2023年05月28日, 第二十屆中國國際檢驗醫(yī)學暨輸血儀器試劑博覽會(CACLP) 在南昌綠地國際博覽中心開幕。當日上午, “智慧降本·精準測序:長讀長測序技術應用進展研討會暨安序源新品發(fā)布會” 成功舉辦, 第四代測序企業(yè)安序源正式發(fā)布其第四代納米孔基因測序平臺:AXP100-RS基因測序儀。

安序源AXP100-RS基因測序儀發(fā)布儀式(圖片來源:安序源)

安序源創(chuàng)始人兼CEO田暉博士、安序源CSO田君君女士、產(chǎn)品總監(jiān)涂浩波等出席了發(fā)布會,同時,受邀出席的業(yè)內(nèi)嘉賓有:億康醫(yī)學產(chǎn)品研究部萬成總監(jiān)、中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所研究員周海健老師、昆明理工大學石宏教授、內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學靳昊博士。

圖片來源:安序源

基因測序技術是我國目前鮮有能夠參與國際化競爭的創(chuàng)新技術, 安序源第四代納米孔基因測序平臺的發(fā)布,標志著我國基因測序技術終于出現(xiàn)了低成本儀器部署、低成本單位數(shù)據(jù)產(chǎn)出的長讀長基因測序技術,進一步創(chuàng)造了我國低成本長讀長基因測序技術的全球競爭力。對于行業(yè)來說,該測序平臺將進一步豐富測序市場格局、促進測序技術迭代升級,并且加速助推測序應用向更深、更廣發(fā)展。

“成本”始終是廣泛應用的決定因素

上世紀70年代出現(xiàn)的一代測序技術雖然準確度高,且在構建載體、基因敲除等實驗中得以廣泛應用,但其在通量、成本、讀長、速度等方面均存在劣勢。隨后出現(xiàn)的二代測序技術(NGS)能夠同時對上百萬甚至數(shù)十億個DNA分子進行測序,實現(xiàn)了大規(guī)模、高通量的測序,但在讀長與速度方面依舊沒有明顯提升。

在計算機學、生物學和化學等多個學科領域的結合發(fā)展下,出現(xiàn)了三代測序技術(SMRT)。該技術的測序讀長可以達到幾十kb級別,解決了一、二代測序技術短讀長的問題,但各家產(chǎn)品又在通量、精度、速度等方面出現(xiàn)了不同程度的性能缺陷,任然不是立足于實際科研和臨床需求的產(chǎn)品。

目前,二、三代測序技術均是基于光信號的測序技術,都需要昂貴的光學監(jiān)測系統(tǒng),并依賴DNA聚合酶讀取堿基序列,大大地増加了測序的成本。因此, 在保證高通量、高精度的情況下,開發(fā)“低成本長讀長測序”產(chǎn)品是行業(yè)亟需的發(fā)展方向。

眾所周知, 技術與性能發(fā)展到一定程度時,“成本”始終是廣泛應用的決定因素 。而根據(jù)AlbertVilella的統(tǒng)計,在儀器部署成本10萬美金以內(nèi)、單位數(shù)據(jù)產(chǎn)出成本1美金以內(nèi)的消費范維,是目前測序領域的“無人區(qū)”。

目前全球基因測序產(chǎn)品價格總覽(圖片來源:安序源)

較高的儀器部署成本使得基層儀器部署數(shù)量難以提升,大規(guī)模普及困難,僅能通過“中心化檢測”使用,但又徒生出樣本運輸、患者異地就醫(yī)等隱形成本。其次,較高的單位數(shù)據(jù)產(chǎn)出成本使得在終端應用場景下的消費價格較高,可支付人群較少,且數(shù)據(jù)積累較少、較慢,不利于技術升級、產(chǎn)品迭代。同時,對于測序企業(yè)而言,較高的單次開機成本使得需要通過湊樣來分攤成本,而湊樣時間的不確定性也讓測序企業(yè)在檢測周期降低方面始終處于被動。

直到安序源第四代納米孔基因測序平臺的出現(xiàn),一切開始了革命性的轉變。

低成本、長讀長、高精度、體積小、檢測快

如行業(yè)所期待的那樣, AXP100-RS基因測序儀集成了低成本、長讀長、高精度、體積小、檢測快的核心優(yōu)勢,是一名獨一無二的“五邊形戰(zhàn)士”。

AXP100-RS基因測序儀優(yōu)勢概覽(圖片來源:安序源)

在AXP100-RS基因測序儀中,經(jīng)過電活性分子修飾標記的單個核苷酸分子將被聚合酶捕獲。接著,在引物鏈延伸的過程中,帶有相應“標簽分子”的核苷酸依次合成。這些標簽分子逐一穿過納米孔將產(chǎn)生特定的電流信號,通過電流信號的變化也就實現(xiàn)了堿基序列的實時表征測定。

通過納米孔測序、環(huán)化校正測序和電信號檢測技術的結合,AXP100-RS基因測序儀讀長長至100kb,單芯片通量可達100Gb/run,且通過環(huán)化測序自糾錯可達到99%的精準度。

同時,該測序儀將測序成本進行了數(shù)量級的下降,每Gb數(shù)據(jù)產(chǎn)出成本顯著低于普遍NGS類產(chǎn)品, 讓樣本擁有了“隨到隨測”的可能性,擺脫湊樣的煩惱。 且該測序儀體積僅,重量約,小巧輕便,使其能夠適配更多應用場景下的測序應用。

在傳染病防控、生殖缺陷防控、癌癥研究與診斷等臨床診斷場景,以及結構變異研究、串聯(lián)重復區(qū)域分析、單基因病研究等科學研究方向上,均是該測序儀能夠“大展拳腳”的場景。

測序成本遠低于1美元/Gb,打造超低成本的測序平臺

AXP100-RS基因測序儀是本次發(fā)布儀式的主角,但其背后聯(lián)動的是第四代納米孔基因測序平臺涵蓋測序全流程的產(chǎn)品體系。

從樣本處理、核酸提取,到文庫制備試劑Xprep kit 100,再到長讀長測序涉及的測序儀AXP100-RS、測序芯片XPU100、測序試劑Xseq kit 100,以及Xconsole 100操作運行與數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。安序源為其領先的基因測序技術配套了完整的軟硬件支持,確保了測序水平的穩(wěn)定性。

其中, 測序芯片XPU100就是第四代納米孔基因測序平臺能夠實現(xiàn)“低成本”測序的關鍵秘密。

基于創(chuàng)始團隊在半導體芯片、高通量基因測序和分子診斷等領域的深厚造詣,以及在半導體、測序行業(yè)的豐富產(chǎn)業(yè)管理經(jīng)驗,以及高質量高體量研發(fā)團隊的潛心耕耘下,安序源開發(fā)出大規(guī)模集成電路、合成化學體系、生物化學體系、生物半導體工藝、電化學與測序、儀器結構與微流控生物芯片集成、數(shù)據(jù)分析與機器學習等核心技術。

測序儀核心零部件XPU100測序芯片傳承了Bio-CMOS芯片AC阻抗檢測靈敏度高、測序快、通量靈活的優(yōu)點,同時提升了抗干擾能力與搭載通量,并在保證最大數(shù)據(jù)產(chǎn)出可達100Gb的情況下,測序成本遠低于1美金/Gb。

也就是說, 安序源采用全球最先進的半導體技術,打造出了最低成本的測序平臺,讓基因測序看到了“隨開隨測”的可能。

全球四代測序蓄勢待發(fā),安序源已遙遙領先

“十年磨劍終成鋒,一朝破竹勢如虹?!?

目前,NGS是業(yè)內(nèi)的主要測序技術,三代測序的應用影響力也正在逐漸提高。但在成本、讀長、精度、等方面依舊存在改進空間。

四代測序正在嘗試著改善這些問題,但由于其極高的技術壁壘和交叉學科應用,需要匯集各領域頂尖人才共同進行創(chuàng)新碰撞,故目前全球“玩家”不多,仍處于蓄勢待發(fā)的階段。

作為融合半導體技術的創(chuàng)新生命科技企業(yè),安序源具備打造多交叉學科先進技術路線的天然優(yōu)勢 。過去數(shù)年,安序源始終堅持研發(fā),已布局納米孔測序儀及配套方案、微陣列芯片檢測儀及檢測試劑盒、POCT檢測產(chǎn)品等完善的產(chǎn)品矩陣方案,并在中美多地建立研發(fā)中心,并廣泛吸納全球不同專業(yè)范疇人才,不斷獲取全球產(chǎn)業(yè)資源,推進自身產(chǎn)業(yè)研發(fā)進程。

目前,公司已快步進入到產(chǎn)業(yè)化、商業(yè)化階段,位于無錫的GMP生產(chǎn)基地已籌建完畢并投入生產(chǎn),同時也在積極進行商業(yè)合作的拓展。本次測序平臺的發(fā)布,也標志著安序源又進入了下一個全新的發(fā)展階段。

未來,安序源依舊將重心聚焦在產(chǎn)品打造,公司希望通過堅實的平臺根基,結合優(yōu)勢的先進半導體技術,拓展多組學、多元化、全生命周期的應用矩陣,并以此開展市場化運作。

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